Юрий Николаевич Божко родился 11 мая 1961 года в селе Жуково Белгородской области. Окончил Воронежский сельскохозяйственный институт по специальности "инженер-механик" и Воронежский государственный университет по специальности "юрист". Начинал карьеру трактористом в колхозе в Белгородской области. После окончания института в 1984 году работал инженером-технологом, главным инженером РТП "Задонское" Задонского района Липецкой области, затем главным инженером передвижной механизированной колонны треста "Мелиоводстрой". С 1987 года — начальник Задонской передвижной механизированной колонны треста "Мелиоводстрой". С 1991 года работал в прокуратуре Задонского района Липецкой области. В июне 1999 года избран главой администрации Задонского района Липецкой области. В 2002 году баллотировался на пост Главы администрации Липецкой области, но снял свою кандидатуру. 14 апреля 2002 года избран депутатом Липецкого областного Совета, оставаясь в должности главы района. В июле 2003 года назначен вице-губернатором Липецкой области и воспринимался как преемник действующего Главы администрации Липецкой области Олега Петровича Королёва. Курировал сферы ЖКХ, экологии, строительства и имущественных отношений. 20 декабря 2006 года назначен первым вице-губернатором. В декабре 2009 года включён в кадровый резерв Президента РФ. 12 апреля 2010 года вошёл в число трёх претендентов на пост губернатора Липецкой области, предложенных для рассмотрения Президенту РФ. В настоящее время является вице-губернатором Липецкой области.