Никита Агафонов родился и живет в городе Елец Липецкой области. Занимается дзюдо. Тренируется в спортивной школе олимпийского резерва "Локомотив". Тренер - Сергей Антонов
В феврале 2018 года на первенстве Центрального федерального округа по дзюдо, которое проходило в Курске, Никита Агафонов занял второе место в весовой категории 73 кг.